Op de Molukken wordt tot in de jaren '60 nog steeds strijd gevoerd door RMS-guerillastrijders onder aanvoering van president mr. dr. Chr.R.S. Soumokil. In 1963 wordt deze gevangen genomen door het Indonesische leger. Na zijn executie in 1966 richt ir. J.A. Manusama in Nederland een regering in ballingschap op en volgt Soumokil op als president.

De executie van Soumokil in 1966 leidt tot de eerste gewelddadige actie van Molukse jongeren in Nederland in de vorm van brandstichting bij de Indonesische ambassade in Den Haag. In de strijd voor een vrije RMS volgen in de jaren daarop meer acties. De bekendste zijn de bezetting van de woning van de Indonesische ambassadeur in Wassenaar in 1970 en de treinkapingen bij Wijster in 1975 en De Punt in 1977. Deze acties laten diepe wonden achter in de Nederlandse én de Molukse samenleving.